在月面战争结束的15年后，在此期间，至少在人类所了解的范围之内并没有出现新的入侵者，随着各个殖民卫星的陆续建成，以及对火星，木星的环境开发。人类真正意义上踏出了宇宙开发的第一步，然而，深植于人类内心深处的嫉妒与贪婪却渐渐开始膨胀，正如没有亲身经历战火的人不知和平的珍贵一般，人类亲手夺回的和平即将被人类亲手破坏掉。
新世纪2140年，beta的一个巢穴突然降落在地球上，并将降落地的利蒙尼西亚完全毁灭。各个国家都派出自己的部分军队组成了国联军，在付出了巨大的代价之后将beta的活动范围限制在一块区域内，但并未将其完全消灭。
在奥布境内的一所名为阵代高中的学校里。
(千鸟要)「响，午休马上要结束了。」
(神城响)「嗯，麻烦你了！」
响赶快将武道服换下，并将器材收拾完毕后立刻离开了截拳道社团教室。毕竟，响是绝对不会错过那位老师的人形兵器驾驶课程。毕竟，那是被誉为阵代高中最美实习 老师的课。
随着一阵急促的铃声响起，响和小要总算及时回到了教室，而坐在响后面的是一位名叫阿德本特的金发少年，总是一副愁眉苦脸的样子望着窗外，据本人所说，完全不记得在其转学过来之前所发生的事，并且脸上几乎没有表露过任何感情，但就是这样的一个人却成为了响转学过来之后得第二个朋友，第一个就是千鸟要了。
和阿德本特不同，响的家人全部都在一场事故中去世了，包括父母和两个妹妹，但是响无法回忆起当时得经历，但他却能感觉到那根本不是一场意外，因此他一直苦练截拳道，并发誓要向那个人复仇。
西条凉音老师推开了教室的门并将手里的书放到了讲台上，响看着眼前的老师总是有种奇怪的感觉，明明她才21岁，本应该是单纯的花季少女般的性格，可一旦在上课时，给人的感觉就像教书几十年的老练先生一样，而下课后就会瞬间从严格的老先生变成可爱少女，仿佛她也是刚下课的学生一般，这种巨大的反差总是让响对凉音老师怀有一种说不出的感觉。
尽管凉音老师在黑板上滔滔不绝的讲着课，但响和阿德本特的心思却完全没有在课堂上。
(凉音)「神城响同学，神城响同学？」
(千鸟)「喂，响，老师在喊你呢！」
千鸟偷偷的提醒正在望向窗外发呆的响。
「啊……是。」
反应过来的响立刻站了起来。
「不可以在上课的时候分神哦！下次再这样老师可要生气了！」
凉音老师的表情仿佛在告诉响她现在的心情很差一般。面对这种尴尬的情况，响不敢直视凉音老师的母光。
「再有下一次……」
就在这时，阿德本特却突然站了起来。
「老师，快带着所有人离开。」
所有人还没反应过来时，学校的操场上突然出现一道空间裂隙，几只恐龙形状的怪兽突然从里面出现，这些怪兽身上还有如七彩的水晶般的装饰，并释放着骇人的威压，面对这种突发情况，刻在基因中的原始恐惧发作，整栋楼里的学生们在尖叫声中失去了秩序，就连凉音老师也被逃命的学生推倒在一旁，而被巨大的尖叫声所吸引，怪兽开始朝着主教学楼的方向前进。
「响，你在干什么啊？快扶着老师先逃再说。」
小要提高了嗓门的音量，以便响能够在人群的尖叫声中听到自己的声音。
「这是……次元兽。」
杂乱的记忆片段在响的脑海中闪现，他下意识的说出了次元兽三个字，父母，妹妹，漆黑的天使，一段一段的破碎画面在响的脑中萦绕，未知的恐惧已经控制了他。
「响，你怎么了？」
阿德本特准备强行拉着响离开，但是响的一只眼睛已经变成了血红色，并在不停地喃喃自语着，好像外界的一切他都感受不到一样，而次元兽也在响发愣时冲到了教室旁，并利用背部的两根角发动了攻击，就在这千钧一发之际，凉音老师一把推开了响，而自己却被倒塌的墙壁压住了下半身，并昏了过去，就在这时，响的血红色眼睛变了回来，而凉音老师早已倒在响的面前，而小要和阿德本特也因为冲击被震到失去意识。
「凉音老师，凉音老师……」
响无法相信眼前的这一幕，他在心中祈求着力量，而且，是为了救凉音老师而祈求着，就在次元兽准备发动下一次攻击时，响的身上突然发出耀眼的白色光芒，而在操场中央出现了与之相对应的黑色光球，并随即展开了一个巨大的黑色印记，一台蓝色的人形机体从印记的中心处缓缓出现，并像有意识般的飞到了响的身边，将被压住的凉音老师以及响送到了驾驶舱，而次元兽对杰尼昂发动的攻击全都被类似立场的结构所阻挡。
不过，令响惊讶的是驾驶舱的设计与小时候母亲所构想的设计完全一致。而母亲所设想的机体名字就叫杰尼昂。
「既然如此，杰尼昂，把你的力量借给我吧！」
杰尼昂也做出了截拳道起手式的姿势。响正在把自己所掌握的招式透过机械驾驶转化为杰尼昂的招式。并一招回旋踢将靠近大楼的次元兽直接踢飞，其余几只次元兽也冲向杰尼昂，但杰尼昂以超快的反应速度利用两把惩罚者腰炮朝着几只次元兽的腿部连续射击，立刻便将高速移动的次元兽瘫痪在地，随即使用装备在背部的冲击短剑朝着几只次元兽的核心进行充能攻击，顺利的击败了次元兽，而被击败的次元兽并没有发生爆炸，而像是卷入次元震般的消失了。
「不仅是思考速度，连反应的速度和移动速度也成倍的提升嘛？」
「或许，借助杰尼昂的力量，终于可以找出那场事故的真相了！」
响回忆起了刚才脑海中的一段帮助自己脱离恐惧的画面，想到这，响急忙脱下自己的外套，并将其撕成布条来给凉音老师紧急止血。就在响忙完这一切后，一台自称为ag的小型机器人出现在杰尼昂驾驶舱中。
(ag)「你好，杰尼昂的新一任驾驶员」
(ag)「我叫ag，是与这台杰尼昂一起传送到这个世界的辅助型ai机器人。」
(响)「刚才的战斗，是你在辅助我吧？」
(ag)「没错，不过现在不是说这些得时候吧？那位美丽的女性可是伤得很严重啊！」
(响)「那这台机体怎么办？这样的战斗肯定会招来军方的人。」
(ag)「不用担心，你离开后我会让这台机体暂时隐藏起来。」
(响)「谢谢。」
(ag)「不用客气，我的任务就是辅助杰尼昂的驾驶员并采集战斗数据。」
说着，响便抱着凉音老师在不引人注目的情况下离开了杰尼昂的驾驶舱，面对这一系列的状况，响显然还没有彻底适应，毕竟，现在发生的这一切于一天前的自己而言简直是做梦都想不到的事。
随后，奥布的军队赶到，协助学生疏散并将受伤的人员全部送往医院。但并未发现学生们所说的蓝色机器人，因此，只好先将此事暂时搁置，协助阵代高中进行建筑修复。