鹿目圆发现自己变得孤独了起来，她的朋友忽然像一夜之间从她身边消失了。
比起箱之魔女更像电视机魔女的魔女引起的事端牵涉了不少人，美树沙耶香也在其中，如果没有佐仓杏子进行干涉的话，那十几个人最多会因为集体癔症之类的名义在医院多做几次检查，但事实证明这一切只是个假设。
仅仅耽搁了很短一点时间，箱之魔女的使魔便对很多人的身体造成了伤害，十几个人都需要在医院里修养一段时间。
而美树沙耶香的伤势最为严重，她的双手被使魔扭断，双腿肌肉拉伤，当时昏迷的情况令她接受治疗之前都没有感受到痛苦。
不知道走运还是不幸的是，因为同样的伤情，美树沙耶香的病房与她心心想念的上条恭介相连，原本美树沙耶香抽空去看望上条恭介，现在的情况是上条恭介坐着轮椅看望美树沙耶香，因为相同而又不同的遭遇，两个少男少女有着共同的语言。
鹿目圆在下午放学之后去看望了美树沙耶香，蓝发的少女双手被石膏固定，走路时一步一颤，用她自己的话说“每一步都像踩着刀子一样剧痛”，但美树沙耶香有上条恭介相伴，却无比地开朗。
志筑仁美也开始陆陆续续地请假，身影消失在了校园当中。
她的理由非常简单，那就是名目繁多的各类考试，茶道、钢琴，也就是志筑仁美平时学习的那些。
还有晓美焰，她当初因为心脏方面的疾病而转学进了见泷原中学，平时都要时不时地进保健室吃药来维持身体，哪怕晓美焰在体育课上表现得比一般人要强大的多。
有着心脏病这个名头，晓美焰的活动轨迹也开始远离了学校。
一时之间，鹿目圆感到了孤独。
但幸好有巴麻美在，温柔而强大的学姐是鹿目圆的一种依靠。
还有那叫做佐仓杏子的少女，她的伤势被学姐以最大的可能修复了，但依然需要静养一个月的时间才能自由地活动，哪怕非常不情愿，红发的少女也只能留在巴麻美学姐的家里。
这个少女身材瘦小，却有着令鹿目圆惊讶的食欲，在相处的时光中，她仿佛一刻不停地在进食。
并且这座城市变得前所未有地和平起来，无论是魔女还是它们的使魔，仿佛从来没有出现过一样，再也没有人因为接触到奇奇怪怪的事情而受到伤害了。
可是这并不是一件好事，巴麻美学姐与佐仓杏子的灵魂宝石随着时间的推移开始被污秽所沾染，逐渐变得暗淡起来，这时候的她们需要悲伤之种净化。
鹿目圆有种预感，一旦灵魂宝石完全被污秽充斥，将会发生非常不好的事情，这份直觉令她午夜梦回时常常眼角带泪，仿佛梦境中预料到了什么。
可是她什么都做不到，这种城市再也没有魔女的踪迹，学姐没有了战斗的理由，也没有获取悲伤之种的机会。
她必须想办法阻止这一切，小圆第一时间想到了晓美焰，只有这位神秘到连丘比都不知道如何诞生的魔法少女才有富足的悲伤之种，也只有她才能解释自己心中的疑惑。
那黑色长发的少女仿佛出现在她千百次的梦回当中。
晓美焰的家庭地址并不难搞到，鹿目圆有一个卫生委员的职位，以关心同学身体情况的名义，她非常方便地就从老师那里得到了自己想要的地址。
在鹿目圆颤颤巍巍地按响门铃之后，房门打开了，面无表情的晓美焰盯着扭捏的鹿目圆看了许久，才正式让她进入自己的家门。
这间屋子里并不是只有晓美焰一个人，绿色头发的志筑仁美也在这里，并且翻阅着一份份的资料，那是各类武器的结构图。
“仁美同学……？”看到熟悉的人，鹿目圆感到惊讶，她的记忆当中，志筑仁美与晓美焰就是两条并行的线，永远不会产生额外的交集，但是她们两个如今却亲密地在很晚的时候待在一起。
“啊，是小圆啊！”志筑仁美非常热情地起身，牵着茫然的鹿目圆的手。
虽然有晓美焰共同分担压力，但她依然需要过一个少女应当度过的生活，作为人生的调剂品与减压——就像之前她的课余生活被这样那样的课程所占满了，却依然会抽空参加鹿目圆以及美树沙耶香所组成的三人女子会。
过去的这些天里，志筑仁美一直跟着晓美焰学习关于人类各种武器的知识，并将其用灯戒具现化出来投入实际应用，在一次次的战斗中磨砺自己战斗的技巧，与晓美焰的战术配合，这就是见泷原最近如此平静的原因，一切的魔女与使魔都成为了两人的磨刀石。
“这里不欢迎你……丘比。”晓美焰冷漠的声音打断了两人的重逢。
闻言，鹿目圆扭头看去，发现白色的丘比不知何时跟着自己进入晓美焰的家里。
而志筑仁美就像被踩到尾巴的猫一样，瞬间做出来反应，金黄色的装甲覆盖在她的身上，一柄同样颜色的枪械出现在其手中，黑洞洞的枪口瞄准了瞪着红色眼睛的丘比。
“可恶的窃贼，孵化者！”
作为合作的根基，晓美焰向志筑仁美讲述了自己的过去，那不断重复着的数周时间，那不断被干涉而无法彻底扭转的命运。
作为一切悲剧的根源，以丘比为代号的孵化者就是幕后黑手。
即便志筑仁美知道这只是千万个丘比中的一个，是某个意识操控下的一个个体，志筑仁美依然如同应激一般想要消灭出现在自己面前的这一只。
“等一下，即便你现在杀了它，也无法改变什么……至少，美树沙耶香和小圆没有成为它的牺牲品，这些就足够了。”晓美焰走到志筑仁美面前，按下了她的枪口，然后又对丘比说到：“孵化者，你已经知道自己想要的事情了，为什么还会上门送死。”
丘比并没有为自己辩解，而是看着晓美焰说到：“谢谢你，时间的逆行者，晓美焰，正是你的所作所为，才让鹿目圆拥有了现在这无以伦比的天赋，让原本并不起眼的一个少女成为了足以神化的潜质。”